Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01545Q5VT33 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms