Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Q5VSD8 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Q5VSD8 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q5VSD8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q5VSD8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q5VSD8 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q5VSD8 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q5VSD8 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q5VSD8 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q5VSD8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q5VSD8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q5VSD8 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q5VSD8 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q5VSD8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q5VSD8 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q5VSD8 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q5VSD8 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms