Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00303Q3SY05 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms