Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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