Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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