Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCBQ16585 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCBQ16585 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCBQ16585 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SGCBQ16585 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SGCBQ16585 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SGCBQ16585 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCBQ16585 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCBQ16585 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SGCBQ16585 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCBQ16585 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCBQ16585 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCBQ16585 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCBQ16585 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCBQ16585 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCBQ16585 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SGCBQ16585 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCBQ16585 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCBQ16585 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCBQ16585 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCBQ16585 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCBQ16585 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCBQ16585 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SGCBQ16585 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCBQ16585 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCBQ16585 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCBQ16585 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCBQ16585 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCBQ16585 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCBQ16585 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCBQ16585 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCBQ16585 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCBQ16585 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCBQ16585 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCBQ16585 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCBQ16585 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SGCBQ16585 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCBQ16585 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCBQ16585 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCBQ16585 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCBQ16585 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCBQ16585 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCBQ16585 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCBQ16585 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SGCBQ16585 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SGCBQ16585 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCBQ16585 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCBQ16585 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCBQ16585 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCBQ16585 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCBQ16585 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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