Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF2Q15853 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF2Q15853 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF2Q15853 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF2Q15853 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF2Q15853 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF2Q15853 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF2Q15853 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF2Q15853 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF2Q15853 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF2Q15853 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF2Q15853 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF2Q15853 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF2Q15853 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF2Q15853 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF2Q15853 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF2Q15853 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF2Q15853 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF2Q15853 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF2Q15853 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF2Q15853 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF2Q15853 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
USF2Q15853 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF2Q15853 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
USF2Q15853 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF2Q15853 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF2Q15853 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF2Q15853 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF2Q15853 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF2Q15853 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF2Q15853 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
USF2Q15853 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF2Q15853 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF2Q15853 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF2Q15853 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF2Q15853 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF2Q15853 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF2Q15853 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF2Q15853 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF2Q15853 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF2Q15853 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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