Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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NEDD8Q15843 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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NEDD8Q15843 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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NEDD8Q15843 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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NEDD8Q15843 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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NEDD8Q15843 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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NEDD8Q15843 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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NEDD8Q15843 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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NEDD8Q15843 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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NEDD8Q15843 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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NEDD8Q15843 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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NEDD8Q15843 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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