Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB35Q15286 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms