Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRKQ15262 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
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