Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EEA1Q15075 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms