Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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COL4A6Q14031 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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COL4A6Q14031 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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COL4A6Q14031 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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COL4A6Q14031 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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COL4A6Q14031 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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COL4A6Q14031 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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COL4A6Q14031 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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COL4A6Q14031 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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