Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms