Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PUDPQ08623 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PUDPQ08623 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PUDPQ08623 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PUDPQ08623 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PUDPQ08623 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PUDPQ08623 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PUDPQ08623 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PUDPQ08623 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PUDPQ08623 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PUDPQ08623 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PUDPQ08623 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PUDPQ08623 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PUDPQ08623 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PUDPQ08623 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PUDPQ08623 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PUDPQ08623 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PUDPQ08623 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PUDPQ08623 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PUDPQ08623 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PUDPQ08623 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PUDPQ08623 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PUDPQ08623 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PUDPQ08623 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PUDPQ08623 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PUDPQ08623 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PUDPQ08623 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PUDPQ08623 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PUDPQ08623 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PUDPQ08623 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PUDPQ08623 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PUDPQ08623 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms