Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CD164Q04900 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CD164Q04900 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CD164Q04900 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CD164Q04900 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
CD164Q04900 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CD164Q04900 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CD164Q04900 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CD164Q04900 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CD164Q04900 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CD164Q04900 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CD164Q04900 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CD164Q04900 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CD164Q04900 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CD164Q04900 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CD164Q04900 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CD164Q04900 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CD164Q04900 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CD164Q04900 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms