Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRB1P82279 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRB1P82279 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRB1P82279 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CRB1P82279 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRB1P82279 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CRB1P82279 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRB1P82279 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRB1P82279 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRB1P82279 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRB1P82279 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRB1P82279 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRB1P82279 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRB1P82279 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRB1P82279 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CRB1P82279 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRB1P82279 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRB1P82279 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRB1P82279 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRB1P82279 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRB1P82279 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRB1P82279 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRB1P82279 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CRB1P82279 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CRB1P82279 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRB1P82279 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRB1P82279 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRB1P82279 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRB1P82279 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRB1P82279 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRB1P82279 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRB1P82279 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRB1P82279 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRB1P82279 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRB1P82279 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRB1P82279 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB1P82279 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB1P82279 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB1P82279 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB1P82279 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB1P82279 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB1P82279 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB1P82279 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB1P82279 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB1P82279 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB1P82279 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB1P82279 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB1P82279 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB1P82279 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB1P82279 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB1P82279 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB1P82279 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB1P82279 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB1P82279 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB1P82279 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB1P82279 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB1P82279 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB1P82279 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB1P82279 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB1P82279 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB1P82279 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB1P82279 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB1P82279 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB1P82279 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB1P82279 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB1P82279 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB1P82279 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB1P82279 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB1P82279 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB1P82279 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB1P82279 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB1P82279 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRB1P82279 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRB1P82279 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRB1P82279 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRB1P82279 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRB1P82279 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRB1P82279 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRB1P82279 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CRB1P82279 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRB1P82279 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRB1P82279 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRB1P82279 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRB1P82279 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRB1P82279 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRB1P82279 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRB1P82279 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRB1P82279 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRB1P82279 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CRB1P82279 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRB1P82279 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRB1P82279 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRB1P82279 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRB1P82279 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRB1P82279 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CRB1P82279 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRB1P82279 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRB1P82279 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRB1P82279 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRB1P82279 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms