Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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