Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP1P63208 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP1P63208 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP1P63208 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP1P63208 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP1P63208 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP1P63208 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP1P63208 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP1P63208 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP1P63208 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP1P63208 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP1P63208 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP1P63208 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP1P63208 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP1P63208 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP1P63208 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP1P63208 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP1P63208 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP1P63208 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP1P63208 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP1P63208 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP1P63208 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP1P63208 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP1P63208 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP1P63208 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP1P63208 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP1P63208 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP1P63208 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP1P63208 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP1P63208 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP1P63208 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP1P63208 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP1P63208 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP1P63208 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP1P63208 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP1P63208 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP1P63208 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP1P63208 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP1P63208 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP1P63208 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP1P63208 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP1P63208 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP1P63208 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP1P63208 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP1P63208 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP1P63208 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP1P63208 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP1P63208 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP1P63208 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP1P63208 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP1P63208 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP1P63208 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP1P63208 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP1P63208 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP1P63208 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP1P63208 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP1P63208 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP1P63208 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP1P63208 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP1P63208 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP1P63208 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP1P63208 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP1P63208 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP1P63208 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP1P63208 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP1P63208 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP1P63208 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP1P63208 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP1P63208 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP1P63208 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP1P63208 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP1P63208 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP1P63208 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP1P63208 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP1P63208 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP1P63208 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP1P63208 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP1P63208 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP1P63208 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP1P63208 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP1P63208 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP1P63208 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP1P63208 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP1P63208 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP1P63208 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP1P63208 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP1P63208 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP1P63208 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP1P63208 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP1P63208 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP1P63208 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP1P63208 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP1P63208 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP1P63208 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP1P63208 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP1P63208 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP1P63208 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP1P63208 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP1P63208 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP1P63208 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms