Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
UFM1P61960 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
UFM1P61960 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UFM1P61960 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UFM1P61960 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UFM1P61960 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UFM1P61960 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UFM1P61960 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
UFM1P61960 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UFM1P61960 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
UFM1P61960 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UFM1P61960 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UFM1P61960 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UFM1P61960 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UFM1P61960 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UFM1P61960 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UFM1P61960 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UFM1P61960 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UFM1P61960 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UFM1P61960 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UFM1P61960 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UFM1P61960 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UFM1P61960 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UFM1P61960 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UFM1P61960 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UFM1P61960 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UFM1P61960 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFM1P61960 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFM1P61960 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFM1P61960 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFM1P61960 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFM1P61960 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFM1P61960 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFM1P61960 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFM1P61960 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFM1P61960 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFM1P61960 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFM1P61960 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFM1P61960 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UFM1P61960 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFM1P61960 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFM1P61960 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFM1P61960 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFM1P61960 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFM1P61960 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFM1P61960 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UFM1P61960 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFM1P61960 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFM1P61960 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFM1P61960 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UFM1P61960 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFM1P61960 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UFM1P61960 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFM1P61960 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFM1P61960 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFM1P61960 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFM1P61960 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFM1P61960 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFM1P61960 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UFM1P61960 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFM1P61960 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFM1P61960 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFM1P61960 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFM1P61960 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFM1P61960 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFM1P61960 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFM1P61960 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFM1P61960 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFM1P61960 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFM1P61960 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFM1P61960 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFM1P61960 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFM1P61960 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFM1P61960 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFM1P61960 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFM1P61960 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFM1P61960 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFM1P61960 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFM1P61960 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFM1P61960 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFM1P61960 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFM1P61960 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFM1P61960 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFM1P61960 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFM1P61960 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFM1P61960 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFM1P61960 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFM1P61960 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFM1P61960 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFM1P61960 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFM1P61960 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFM1P61960 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFM1P61960 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UFM1P61960 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFM1P61960 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UFM1P61960 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFM1P61960 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFM1P61960 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFM1P61960 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFM1P61960 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms