Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERVS71-1P61550 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms