Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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