Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms