Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERFP50548 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERFP50548 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERFP50548 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERFP50548 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ERFP50548 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERFP50548 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERFP50548 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERFP50548 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERFP50548 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERFP50548 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERFP50548 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERFP50548 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ERFP50548 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERFP50548 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERFP50548 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERFP50548 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERFP50548 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERFP50548 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ERFP50548 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ERFP50548 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERFP50548 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERFP50548 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERFP50548 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERFP50548 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERFP50548 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERFP50548 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERFP50548 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERFP50548 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERFP50548 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERFP50548 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERFP50548 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERFP50548 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERFP50548 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERFP50548 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERFP50548 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERFP50548 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERFP50548 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERFP50548 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERFP50548 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERFP50548 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERFP50548 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERFP50548 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERFP50548 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERFP50548 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERFP50548 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERFP50548 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERFP50548 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERFP50548 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERFP50548 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERFP50548 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERFP50548 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERFP50548 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERFP50548 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERFP50548 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERFP50548 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERFP50548 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERFP50548 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERFP50548 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERFP50548 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERFP50548 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERFP50548 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERFP50548 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERFP50548 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ERFP50548 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERFP50548 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERFP50548 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERFP50548 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERFP50548 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERFP50548 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERFP50548 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERFP50548 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERFP50548 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERFP50548 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERFP50548 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERFP50548 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERFP50548 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERFP50548 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERFP50548 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERFP50548 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERFP50548 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERFP50548 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERFP50548 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERFP50548 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERFP50548 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERFP50548 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERFP50548 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERFP50548 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERFP50548 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERFP50548 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERFP50548 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERFP50548 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERFP50548 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERFP50548 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERFP50548 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERFP50548 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERFP50548 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERFP50548 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERFP50548 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERFP50548 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms