Protein–RNA interactions for Protein: P50135

HNMT, Histamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNMTP50135 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HNMTP50135 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HNMTP50135 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNMTP50135 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNMTP50135 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNMTP50135 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNMTP50135 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNMTP50135 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNMTP50135 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNMTP50135 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNMTP50135 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNMTP50135 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNMTP50135 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNMTP50135 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNMTP50135 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNMTP50135 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNMTP50135 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNMTP50135 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNMTP50135 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNMTP50135 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNMTP50135 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HNMTP50135 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNMTP50135 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNMTP50135 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNMTP50135 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNMTP50135 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNMTP50135 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNMTP50135 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNMTP50135 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNMTP50135 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNMTP50135 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNMTP50135 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNMTP50135 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNMTP50135 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNMTP50135 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNMTP50135 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNMTP50135 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNMTP50135 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNMTP50135 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNMTP50135 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNMTP50135 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HNMTP50135 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNMTP50135 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNMTP50135 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNMTP50135 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNMTP50135 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HNMTP50135 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNMTP50135 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNMTP50135 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNMTP50135 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNMTP50135 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNMTP50135 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNMTP50135 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNMTP50135 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNMTP50135 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNMTP50135 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNMTP50135 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNMTP50135 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNMTP50135 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNMTP50135 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNMTP50135 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNMTP50135 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNMTP50135 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNMTP50135 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNMTP50135 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNMTP50135 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNMTP50135 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNMTP50135 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNMTP50135 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNMTP50135 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNMTP50135 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNMTP50135 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNMTP50135 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNMTP50135 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNMTP50135 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNMTP50135 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNMTP50135 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNMTP50135 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNMTP50135 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNMTP50135 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNMTP50135 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNMTP50135 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HNMTP50135 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNMTP50135 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNMTP50135 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNMTP50135 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNMTP50135 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNMTP50135 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNMTP50135 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNMTP50135 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HNMTP50135 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HNMTP50135 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNMTP50135 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HNMTP50135 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HNMTP50135 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HNMTP50135 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HNMTP50135 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HNMTP50135 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HNMTP50135 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HNMTP50135 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms