Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX1P48742 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX1P48742 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX1P48742 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX1P48742 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX1P48742 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX1P48742 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX1P48742 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX1P48742 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX1P48742 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX1P48742 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX1P48742 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX1P48742 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX1P48742 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX1P48742 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX1P48742 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX1P48742 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX1P48742 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX1P48742 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX1P48742 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX1P48742 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX1P48742 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX1P48742 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX1P48742 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX1P48742 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX1P48742 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX1P48742 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX1P48742 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX1P48742 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX1P48742 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX1P48742 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX1P48742 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX1P48742 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX1P48742 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX1P48742 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX1P48742 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX1P48742 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX1P48742 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX1P48742 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX1P48742 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX1P48742 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX1P48742 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX1P48742 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX1P48742 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX1P48742 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX1P48742 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX1P48742 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX1P48742 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX1P48742 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX1P48742 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX1P48742 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX1P48742 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX1P48742 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX1P48742 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX1P48742 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX1P48742 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX1P48742 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX1P48742 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX1P48742 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX1P48742 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX1P48742 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX1P48742 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX1P48742 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX1P48742 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX1P48742 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX1P48742 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX1P48742 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX1P48742 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX1P48742 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX1P48742 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX1P48742 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX1P48742 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX1P48742 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX1P48742 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX1P48742 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX1P48742 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX1P48742 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX1P48742 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX1P48742 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX1P48742 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX1P48742 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX1P48742 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX1P48742 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX1P48742 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX1P48742 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX1P48742 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX1P48742 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX1P48742 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX1P48742 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX1P48742 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX1P48742 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX1P48742 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX1P48742 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX1P48742 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX1P48742 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX1P48742 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX1P48742 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX1P48742 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX1P48742 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LHX1P48742 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms