Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms