Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFE3P19532 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFE3P19532 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFE3P19532 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TFE3P19532 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TFE3P19532 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFE3P19532 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFE3P19532 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFE3P19532 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFE3P19532 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFE3P19532 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFE3P19532 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFE3P19532 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TFE3P19532 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFE3P19532 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFE3P19532 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFE3P19532 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFE3P19532 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFE3P19532 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFE3P19532 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFE3P19532 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFE3P19532 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFE3P19532 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TFE3P19532 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFE3P19532 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFE3P19532 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFE3P19532 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFE3P19532 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFE3P19532 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFE3P19532 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFE3P19532 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TFE3P19532 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TFE3P19532 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFE3P19532 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFE3P19532 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFE3P19532 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFE3P19532 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFE3P19532 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFE3P19532 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFE3P19532 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TFE3P19532 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFE3P19532 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFE3P19532 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFE3P19532 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFE3P19532 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFE3P19532 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFE3P19532 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TFE3P19532 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFE3P19532 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TFE3P19532 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFE3P19532 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TFE3P19532 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFE3P19532 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFE3P19532 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFE3P19532 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFE3P19532 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFE3P19532 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFE3P19532 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFE3P19532 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFE3P19532 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFE3P19532 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFE3P19532 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFE3P19532 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFE3P19532 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFE3P19532 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFE3P19532 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TFE3P19532 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFE3P19532 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFE3P19532 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFE3P19532 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFE3P19532 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFE3P19532 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFE3P19532 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFE3P19532 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TFE3P19532 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFE3P19532 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFE3P19532 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFE3P19532 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFE3P19532 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFE3P19532 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFE3P19532 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFE3P19532 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFE3P19532 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFE3P19532 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFE3P19532 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFE3P19532 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFE3P19532 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFE3P19532 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFE3P19532 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFE3P19532 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFE3P19532 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFE3P19532 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFE3P19532 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFE3P19532 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFE3P19532 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFE3P19532 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFE3P19532 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFE3P19532 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFE3P19532 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFE3P19532 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms