Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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