Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKAP2O75563 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms