Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
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