Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms