Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms