Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms