Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.8 ms