Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms