Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHFRQ96EP1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms