Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB13Q92826 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms