Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms