Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms