Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms