Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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ATG4DQ86TL0 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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ATG4DQ86TL0 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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ATG4DQ86TL0 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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ATG4DQ86TL0 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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ATG4DQ86TL0 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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ATG4DQ86TL0 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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ATG4DQ86TL0 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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