Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY09

CEACAM20, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 20, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM20Q6UY09 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM20Q6UY09 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms