Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms