Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms