Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms