Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SLX4IPQ5VYV7 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 369.7 ms