Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF1Q3BBV0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms