Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGSM1Q2NKQ1 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGSM1Q2NKQ1 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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