Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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