Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 GACAT2-201ENST00000579368 818 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 MIEF1-215ENST00000637854 213 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AL359458.1-201ENST00000430821 400 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 DERL2-206ENST00000572834 589 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
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